Aujourd'hui nous travaillons sur l'examen de l'année dernière pour utiliser tout ce qu'on nous avons appris précédemment.
vendredi 12 juin 2009
Option Bioinformatique #7 : révisions
Par Alexis Lefebvre le vendredi 12 juin 2009, 16:23
mardi 9 juin 2009
La Biologie Moléculaire "In Silico"
Par Alexis Lefebvre le mardi 9 juin 2009, 21:45
Aujourd'hui avait lieu ce TD qui rentre dans le cadre de l'unité Génétique Moléculaire. Son objectif était de nous faire découvrir les outils bio-informatiques utilisés en biologie moléculaire.
lundi 8 juin 2009
TD de Biostatistiques #7
Par Alexis Lefebvre le lundi 8 juin 2009, 14:12
Aujourd'hui nous avons travaillé presque exclusivement avec Prism pour tester si des populations étaient gaussiennes et si la différence entre 2 moyennes de plusieurs valeurs suivaient une loi normale.
Nous avons ensuite vus les tests de Wilcoxon et Mann & Whitney.
Logiciels utilisés :
- Tableur Open Office (OpenOffice.org Calc)
- GraphPad Prism, un logiciel propriétaire de calcul statistique
vendredi 5 juin 2009
Option Bioinformatique #6 : découverte de BioPython
Par Alexis Lefebvre le vendredi 5 juin 2009, 16:44
Aujourd'hui nous découvrons BioPython, un module pour Python dédié à la Biologie.
TD de Biostatistiques #6
Par Alexis Lefebvre le vendredi 5 juin 2009, 13:14
Cette semaine nous avons testé si des populations étaient gaussiennes et utilisé les tests de Kolmogorov-Smirnov, Wilcoxon et Student pour déterminer l'efficacité d'un traitement. Nous avons ensuite utilisé la loi normale puis le test de Fisher.
Logiciels utilisés :
- Tableur Open Office (OpenOffice.org Calc)
- GraphPad Prism, un logiciel propriétaire de calcul statistique
vendredi 29 mai 2009
Option Bioinformatique #5
Par Alexis Lefebvre le vendredi 29 mai 2009, 19:20
Cette semaine nous avons découvert les modules de Python, comment les appeler et les utiliser. Nous avons ensuite appris à utiliser les expressions régulières.
TD de Biostatistiques #5
Par Alexis Lefebvre le vendredi 29 mai 2009, 19:08
Nous avons effectués des tests statistiques en utilisant de nouveaux tests :
- le test de Wilcoxon
- le test de Kolmogorov-Smirnov
- le test de Student
Logiciels utilisés :
- Tableur Open Office (OpenOffice.org Calc)
- GraphPad Prism, un logiciel propriétaire de calcul statistique
lundi 25 mai 2009
TD de Biostatistiques #4
Par Alexis Lefebvre le lundi 25 mai 2009, 21:28
Nous avons eu le premier contrôle de cette matière puis nous avons travaillé sur des tests statistiques en utilisant la loi normale et la loi binomiale, le premier test étant exact et le second approximatif.
dimanche 24 mai 2009
Installer fish, un shell interactif agréable
Par Alexis Lefebvre le dimanche 24 mai 2009, 19:02
J'utilise la distribution Linux Ubuntu depuis environ 3 ans. J'utilisais le shell par défaut bash sans savoir qu'on pouvait en utiliser un autre. J'ai découvert le shell fish par hasard en lisant les commentaires d'une nouvelle sur LinuxFr.org, je l'ai installé et l'ai adopté.
vendredi 22 mai 2009
Option Bioinformatique #4
Par Alexis Lefebvre le vendredi 22 mai 2009, 19:23
Cette semaine nous avons continué les exercices avec Python.
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