jeudi 18 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le jeudi 18 juin 2009, 19:52
En cours de BioInformatique, nous avons découvert BioPython. Ce framework a-t-il des équivalents ? D'autres langages ont-ils leur Bio* ?
lundi 15 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le lundi 15 juin 2009, 14:16
Nous avons travaillé sur des données expérimentales fournies par une thésarde puis nous avons passé le second examen de TD.
Logiciels utilisés :
vendredi 12 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 12 juin 2009, 16:23
Aujourd'hui nous travaillons sur l'examen de l'année dernière pour utiliser tout ce qu'on nous avons appris précédemment.
mardi 9 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le mardi 9 juin 2009, 21:45
Aujourd'hui avait lieu ce TD qui rentre dans le cadre de l'unité Génétique Moléculaire. Son objectif était de nous faire découvrir les outils bio-informatiques utilisés en biologie moléculaire.
lundi 8 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le lundi 8 juin 2009, 14:12
Aujourd'hui nous avons travaillé presque exclusivement avec Prism pour tester si des populations étaient gaussiennes et si la différence entre 2 moyennes de plusieurs valeurs suivaient une loi normale.
Nous avons ensuite vus les tests de Wilcoxon et Mann & Whitney.
Logiciels utilisés :
vendredi 5 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 5 juin 2009, 16:44
Aujourd'hui nous découvrons BioPython, un module pour Python dédié à la Biologie.
Par Alexis Lefebvre le vendredi 5 juin 2009, 13:14
Cette semaine nous avons testé si des populations étaient gaussiennes et utilisé les tests de Kolmogorov-Smirnov, Wilcoxon et Student pour déterminer l'efficacité d'un traitement. Nous avons ensuite utilisé la loi normale puis le test de Fisher.
Logiciels utilisés :
vendredi 29 mai 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 29 mai 2009, 19:20
Cette semaine nous avons découvert les modules de Python, comment les appeler et les utiliser. Nous avons ensuite appris à utiliser les expressions régulières.
Par Alexis Lefebvre le vendredi 29 mai 2009, 19:08
Nous avons effectués des tests statistiques en utilisant de nouveaux tests :
Logiciels utilisés :
lundi 25 mai 2009
Par Alexis Lefebvre le lundi 25 mai 2009, 21:28
Nous avons eu le premier contrôle de cette matière puis nous avons travaillé sur des tests statistiques en utilisant la loi normale et la loi binomiale, le premier test étant exact et le second approximatif.
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