lundi 1 février 2010
Par Alexis Lefebvre le lundi 1 février 2010, 14:56
Pendant la première semaine du second semestre nous avons eu des cours de BioStatistiques avec le langage R et d'Informatique avec le langage Python.
J'avais fait du R lors de mon stage en utilisant quelques fonctions qui suffisaient à nos besoins. J'ai pu approfondir mes connaissances en R grâce à cette présentation détaillée. J'ai été impressionné par la programmation vectorielle qui permet de se passer de boucles.
mardi 26 janvier 2010
Par Alexis Lefebvre le mardi 26 janvier 2010, 09:45
Le second semestre a commencé hier. Pendant les deux semaines qui viennent, nous allons apprendre à utiliser R et Python. La troisième semaine, nous devrons mettre à profit nos compétences pour élaborer un projet personnel de BioInformatique.
vendredi 19 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 19 juin 2009, 18:36
L'examen d'aujourd'hui demandait d'utiliser des algorithmes écrits pendant les séances précédentes.
jeudi 18 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le jeudi 18 juin 2009, 19:52
En cours de BioInformatique, nous avons découvert BioPython. Ce framework a-t-il des équivalents ? D'autres langages ont-ils leur Bio* ?
vendredi 12 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 12 juin 2009, 16:23
Aujourd'hui nous travaillons sur l'examen de l'année dernière pour utiliser tout ce qu'on nous avons appris précédemment.
vendredi 5 juin 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 5 juin 2009, 16:44
Aujourd'hui nous découvrons BioPython, un module pour Python dédié à la Biologie.
vendredi 29 mai 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 29 mai 2009, 19:20
Cette semaine nous avons découvert les modules de Python, comment les appeler et les utiliser. Nous avons ensuite appris à utiliser les expressions régulières.
vendredi 22 mai 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 22 mai 2009, 19:23
Cette semaine nous avons continué les exercices avec Python.
vendredi 15 mai 2009
Par Alexis Lefebvre le vendredi 15 mai 2009, 19:09
Aujourd'hui, dans le 3ème TP de l'option Bioinformatique, nous sommes revenus sur les précédents cours puis nous avons continué à découvrir Python. Le cours a porté sur la lecture de fichiers texte, la création de fonctions et les dictionnaires (aussi appelés tableaux dans d'autres langages).
Cette création est mise à disposition sous un contrat Creative Commons.