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lundi 1 février 2010

Résumé de la première semaine du second semestre

Pendant la première semaine du second semestre nous avons eu des cours de BioStatistiques avec le langage R et d'Informatique avec le langage Python.

J'avais fait du R lors de mon stage en utilisant quelques fonctions qui suffisaient à nos besoins. J'ai pu approfondir mes connaissances en R grâce à cette présentation détaillée. J'ai été impressionné par la programmation vectorielle qui permet de se passer de boucles.

mardi 26 janvier 2010

Début du second semestre

Le second semestre a commencé hier. Pendant les deux semaines qui viennent, nous allons apprendre à utiliser R et Python. La troisième semaine, nous devrons mettre à profit nos compétences pour élaborer un projet personnel de BioInformatique.

vendredi 19 juin 2009

Option Bioinformatique #8 : examen

L'examen d'aujourd'hui demandait d'utiliser des algorithmes écrits pendant les séances précédentes.

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jeudi 18 juin 2009

Quel langage informatique pour travailler avec des données biologiques ?

En cours de BioInformatique, nous avons découvert BioPython. Ce framework a-t-il des équivalents ? D'autres langages ont-ils leur Bio* ?

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vendredi 12 juin 2009

Option Bioinformatique #7 : révisions

Aujourd'hui nous travaillons sur l'examen de l'année dernière pour utiliser tout ce qu'on nous avons appris précédemment.

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vendredi 5 juin 2009

Option Bioinformatique #6 : découverte de BioPython

Aujourd'hui nous découvrons BioPython, un module pour Python dédié à la Biologie.

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vendredi 29 mai 2009

Option Bioinformatique #5

Cette semaine nous avons découvert les modules de Python, comment les appeler et les utiliser. Nous avons ensuite appris à utiliser les expressions régulières.

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vendredi 22 mai 2009

Option Bioinformatique #4

Cette semaine nous avons continué les exercices avec Python.

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vendredi 15 mai 2009

Option Bioinformatique #3

Aujourd'hui, dans le 3ème TP de l'option Bioinformatique, nous sommes revenus sur les précédents cours puis nous avons continué à découvrir Python. Le cours a porté sur la lecture de fichiers texte, la création de fonctions et les dictionnaires (aussi appelés tableaux dans d'autres langages).

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