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lundi 8 juin 2009

TD de Biostatistiques #7

Aujourd'hui nous avons travaillé presque exclusivement avec Prism pour tester si des populations étaient gaussiennes et si la différence entre 2 moyennes de plusieurs valeurs suivaient une loi normale.

Nous avons ensuite vus les tests de Wilcoxon et Mann & Whitney.

Logiciels utilisés :

vendredi 5 juin 2009

Option Bioinformatique #6 : découverte de BioPython

Aujourd'hui nous découvrons BioPython, un module pour Python dédié à la Biologie.

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TD de Biostatistiques #6

Cette semaine nous avons testé si des populations étaient gaussiennes et utilisé les tests de Kolmogorov-Smirnov, Wilcoxon et Student pour déterminer l'efficacité d'un traitement. Nous avons ensuite utilisé la loi normale puis le test de Fisher.

Logiciels utilisés :

vendredi 29 mai 2009

Option Bioinformatique #5

Cette semaine nous avons découvert les modules de Python, comment les appeler et les utiliser. Nous avons ensuite appris à utiliser les expressions régulières.

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TD de Biostatistiques #5

Nous avons effectués des tests statistiques en utilisant de nouveaux tests :

  • le test de Wilcoxon
  • le test de Kolmogorov-Smirnov
  • le test de Student

Logiciels utilisés :

lundi 25 mai 2009

TD de Biostatistiques #4

Nous avons eu le premier contrôle de cette matière puis nous avons travaillé sur des tests statistiques en utilisant la loi normale et la loi binomiale, le premier test étant exact et le second approximatif.

vendredi 22 mai 2009

Option Bioinformatique #4

Cette semaine nous avons continué les exercices avec Python.

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lundi 18 mai 2009

TD de Biostatistiques #3

Cette semaine en Biostatistiques nous avons commencé à travailler sur les tests d'indépendance.

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vendredi 15 mai 2009

Option Bioinformatique #3

Aujourd'hui, dans le 3ème TP de l'option Bioinformatique, nous sommes revenus sur les précédents cours puis nous avons continué à découvrir Python. Le cours a porté sur la lecture de fichiers texte, la création de fonctions et les dictionnaires (aussi appelés tableaux dans d'autres langages).

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